Generalmente le celle frigorifere vengono raffreddate mediante macchine frigorifere, utilizzando come refrigeranti liquidi con temperature di evaporazione molto basse (ammoniaca o freon). Questi liquidi evaporano in condizioni di bassa pressione e controllo meccanico, assorbendo il calore all'interno del locale di stoccaggio, raggiungendo così lo scopo di raffreddamento e riduzione della temperatura.
Molto comune è il frigorifero del tipo a compressione, costituito principalmente da compressore, condensatore, valvola a farfalla e tubo di evaporazione. A seconda del modo in cui è installato il tubo di evaporazione, questo può essere suddiviso in raffreddamento diretto e raffreddamento indiretto. Il raffreddamento diretto installa il tubo di evaporazione all'interno della cella frigorifera, dove il liquido refrigerante assorbe direttamente il calore all'interno della stanza attraverso il tubo di evaporazione e si raffredda. Il raffreddamento indiretto è ottenuto da un ventilatore che aspira l'aria dal magazzino in un raffreddamento ad aria dispositivo. L'aria, dopo essere stata raffreddata dal tubo di evaporazione interno al dispositivo di raffreddamento, viene rimandata nell'ambiente per abbattere la temperatura.
Il vantaggio del metodo di raffreddamento ad aria è che si raffredda rapidamente, la temperatura nel magazzino è più uniforme e può anche rimuovere gas nocivi come l'anidride carbonica prodotta durante il processo di stoccaggio.