Το καθαρό υγρό ζάχαρης από το τμήμα προεπεξεργασίας χρησιμοποιείται ως πηγή άνθρακα για ζύμωση. Εισάγονται ειδικευμένα μικροβιακά στελέχη και παρέχεται αποστειρωμένος αέρας. Η θερμοκρασία ελέγχεται με ψύξη μέσω εσωτερικών και εξωτερικών πηνίων στη δεξαμενή ζύμωσης, διατηρώντας την κατάλληλη θερμοκρασία και όγκο αέρα για ζύμωση κιτρικού οξέος. Μετά τη ζύμωση, ο ζωμός ζύμωσης αποθηκεύεται προσωρινά σε δεξαμενή μεταφοράς, στη συνέχεια θερμαίνεται και αποστειρώνεται μέσω εναλλάκτη θερμότητας. Διαχωρίζεται χρησιμοποιώντας ένα φίλτρο πλάκας και πλαισίου, με το υγρό να αποστέλλεται στο τμήμα εκχύλισης και το υπόλειμμα στερεού υγρού οξέος να ξηραίνεται σε στεγνωτήρα δέσμης σωλήνων, να ψύχεται με μεταφορά αέρα και να συσκευάζεται για εξωτερική πώληση.

Το καθαρό υγρό της ζύμωσης κιτρικού οξέος από το τμήμα ζύμωσης χωρίζεται σε δύο μέρη για αντίδραση εξουδετέρωσης TCC και αντίδραση εξουδετέρωσης DCC. Ένα μέρος του καθαρού υγρού αναμιγνύεται με αραιό DCC οξύ και εισέρχεται στη μονάδα αντίδρασης TCC για να αντιδράσει με ανθρακικό ασβέστιο, σχηματίζοντας κιτρικό ασβέστιο. Το άλλο μέρος του διαυγής υγρού αντιδρά με κιτρικό ασβέστιο που παράγεται από την εξουδετέρωση DCC για να σχηματιστεί κιτρικό υδρογόνο ασβεστίου. Το κέικ φίλτρου υδρογόνου ασβεστίου από την εξουδετέρωση DCC χρησιμοποιείται στη μονάδα αντίδρασης οξέόλας, όπου αναμιγνύεται με συμπυκνωμένο θειικό οξύ. Η προκύπτουσα ιλύος αντίδρασης διαχωρίζεται από ένα φίλτρο ιμάντα κενού και το διήθημα υφίσταται περαιτέρω διήθηση μέσω ενός φίλτρου πλάκας και πλαισίου δύο σταδίων για να ληφθεί υγρό εξευγενισμένης οξέόλας. Το κέικ φίλτρου θειικού ασβεστίου που διαχωρίζεται από το φίλτρο ιμάντα κενού μεταφέρεται στην αποθήκευση θειικού ασβεστίου μέσω ενός μεταφορέα βιδών.

Το ραφιναρισμένο υγρό οξέος από το τμήμα εκχύλισης συμπυκνώνεται και στη συνέχεια κρυσταλλώνεται με ψύξη. Διαχωρίζεται χρησιμοποιώντας φυγόκεντρο για να ληφθούν κρύσταλλοι υγρού μονοϋδρικού κιτρικού οξέος. Οι υγροί κρύσταλλοι ξηραίνονται σε στεγνωτήρα ρευστοποιημένου κρεβατιού, διαλύονται και τροφοδοτούνται σε κάδο αποθήκευσης. Μετά τη ζύγιση, τη συσκευασία και την ανίχνευση μετάλλων, λαμβάνεται το τελικό προϊόν μονοϋδρικού κιτρικού οξέος.